NGSure低丰度变异检测定制化服务
基于qPCR和Sanger测序的高性能低丰度变异检测定制化设计服务
BDA技术是一种独特的、全新的基于PCR的突变富集技术。BDA技术可以在野生型DNA背景下选择性地扩增基因突变(如突变、插入和缺失等)。我们在合成的DNA模板、细胞系来源的gDNA和临床血浆cfDNA样本上进行了系统性的验证,证明BDA技术能够稳定地富集低丰度基因突变。 BDA中除了常规的上下游引物外,还引入了Blocker。Blocker被设计成与已知野生型序列完全互补配对,并与上游引物有重叠区域,从而使引物和Blocker之间产生竞争关系。当模板为野生型序列时,Blocker与模板结合能力强于上游引物的结合能力,PCR反应效率低;当模板为突变序列时,上游引物与模板的结合能力强于Blocker的结合能力,PCR反应能够有效进行。引物与Blocker的竞争使得反应体系中的野生型序列和突变型序列被差异扩增放大,经过多轮PCR反应后,突变序列的富集程度可达1000倍。
低突变丰度的基因检测是目前基因检测的难点。传统PCR技术的灵敏度为2%左右,Sanger测序的灵敏度为10%左右。NGS测序则为1%,虽然可以通过超深度测序来进一步提升校测灵敏度,但费用也会快速增加。BDA技术通过特异性富集突变序列,能够极大提高传统PCR技术、Sanger技术和NGS测序的灵敏度,并能够降低NGS测序费用。
革命性的BDA技术,在基因扩增中改变野生型和突变型的热力学差异,通过对突变的富集,将灵敏度大幅提高
使传统的Sanger/qPCR灵敏度提升至0.01%-0.1%,获得等同数字PCR的灵敏度
衍生开发出多项专利技术,适用于PCR、CE、NGS、三代测序、核酸质谱等各个分子诊断技术(专利编号详见下表)
近年来肿瘤液体活检在肿瘤早筛、诊断、用药指导、预后判断等应用越来越广。肿瘤来源的ctDNA半衰期短、含量低、突变丰度低等特点对技术提出了很高的要求。在对ctDNA进行相应基因检测时,瓶颈问题是如何在非肿瘤来源的cfDNA背景下检测到罕见的肿瘤来源的ctDNA。这需要高敏感度、高特异性的检测平台。BDA技术通过特异富集突变序列,在肿瘤液体活检领域以及其他的基因突变检测领域有广阔应用前景。目前已经开发针对非小细胞肺癌、黑色素瘤和泛癌种的相关检测产品。